60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3724 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3724  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 
350 aa  713    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.265365  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0406  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  96.57 
 
 
350 aa  692    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0251824  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3550  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  96.86 
 
 
350 aa  693    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0123013  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0420  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  84.46 
 
 
354 aa  617  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0446  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  85.03 
 
 
354 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0823821  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3894  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  84.75 
 
 
354 aa  614  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.015316  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0432  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  85.03 
 
 
354 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185198  hitchhiker  0.000543609 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0507  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  82.2 
 
 
354 aa  595  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4198  arginase family protein  91.14 
 
 
271 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4095  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  66.28 
 
 
347 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0528  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  66.57 
 
 
344 aa  463  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3791  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  67.16 
 
 
344 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3372  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  65.7 
 
 
347 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.537217  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0462  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  65.4 
 
 
338 aa  450  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0476  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  65.4 
 
 
342 aa  437  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3201  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  63.19 
 
 
345 aa  436  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.791135  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4572  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.23 
 
 
348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.708265  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09036  Formiminoglutamate hydrolase  32.45 
 
 
329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.122241  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4273  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.6 
 
 
323 aa  170  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4413  formimidoylglutamase  25.9 
 
 
320 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.624184 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1279  formiminoglutamase  26.74 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0915  formimidoylglutamase  25.53 
 
 
313 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1596  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  24.64 
 
 
316 aa  56.2  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2010  formiminoglutamase  25.97 
 
 
333 aa  56.2  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2046  formimidoylglutamase  27.24 
 
 
322 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55166  normal  0.477762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0824  formimidoylglutamase  25.18 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5045  formimidoylglutamase  26.92 
 
 
329 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0883  formimidoylglutamase  25.18 
 
 
313 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0938  formimidoylglutamase  25.27 
 
 
313 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.62567 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0852  formimidoylglutamase  24.91 
 
 
313 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1591  formimidoylglutamase  27.92 
 
 
316 aa  53.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854602  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1261  formimidoylglutamase  30.85 
 
 
312 aa  53.5  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2157  formiminoglutamase  25.17 
 
 
322 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30730  formiminoglutamase  27.6 
 
 
329 aa  52.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4072  formimidoylglutamase  27.17 
 
 
311 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2795  formimidoylglutamase  27.78 
 
 
315 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02330  formimidoylglutamase  28.09 
 
 
348 aa  50.4  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  25.91 
 
 
345 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  25.45 
 
 
345 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  25.45 
 
 
345 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2645  formimidoylglutamase  25.62 
 
 
325 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0232342  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  27.48 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2388  formimidoylglutamase  28.17 
 
 
315 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.770652  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2879  formimidoylglutamase  24.18 
 
 
325 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1954  formimidoylglutamase  28.11 
 
 
311 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0479136  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2473  formimidoylglutamase  24.18 
 
 
325 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0824  formimidoylglutamase  24.53 
 
 
336 aa  46.2  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000103972  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3336  formimidoylglutamase  22.64 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.301376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  27.05 
 
 
299 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0764  formimidoylglutamase  22.34 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3677  formimidoylglutamase  23.36 
 
 
323 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.707468  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03170  formiminoglutamase  25.61 
 
 
317 aa  44.3  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0849  formimidoylglutamase  24.47 
 
 
358 aa  43.5  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0322036 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0746  formimidoylglutamase  22.34 
 
 
319 aa  43.5  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  26.41 
 
 
297 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  26.41 
 
 
297 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  27.6 
 
 
297 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  27.6 
 
 
297 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  25.97 
 
 
297 aa  43.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  28.49 
 
 
316 aa  43.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>