18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0988 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0988  hypothetical protein  100 
 
 		 770 aa  1561    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2827  putative TraY/DotA-like type IV secretion system protein  28.42 
 
 		 751 aa  231  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5350  hypothetical protein  25.07 
 
 		 960 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3946  hypothetical protein  23.21 
 
 		 972 aa  160  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046164 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0084  integral membrane protein  24.37 
 
 		 722 aa  154  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.421711  normal  0.537014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2064  integral membrane protein  23.96 
 
 		 653 aa  137  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0863025  normal  0.971709 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0348  DotA  22.98 
 
 		 814 aa  136  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1846  DotA protein  22.86 
 
 		 806 aa  135  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1685  hypothetical protein  24.83 
 
 		 665 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.155635  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3854  hypothetical protein  24.44 
 
 		 776 aa  128  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0069  traY protein  23.2 
 
 		 714 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0064  traY protein  22.42 
 
 		 714 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0097  type IV secretion system protein DotA-like protein  33.14 
 
 		 840 aa  100  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.551932  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4275  hypothetical protein  27.86 
 
 		 880 aa  97.4  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2613  defect in organelle trafficking protein DotA  31.75 
 
 		 1047 aa  95.9  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2740  defect in organelle trafficking protein DotA  31.75 
 
 		 1035 aa  95.5  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1097  hypothetical protein  30.08 
 
 		 842 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.361233  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5612  hypothetical protein  28.1 
 
 		 752 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.334053  normal  0.167609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>