19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4236 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_4236  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4370  hypothetical protein  97.54 
 
 
122 aa  220  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4164  hypothetical protein  97.54 
 
 
122 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3722  hypothetical protein  43.56 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1235  hypothetical protein  37.5 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.145276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1279  hypothetical protein  37.5 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1217  hypothetical protein  39 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1312  hypothetical protein  37.5 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234542  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3078  hypothetical protein  37.5 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.963714  hitchhiker  0.0016345 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1147  hypothetical protein  39 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.46677  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1146  hypothetical protein  39 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279583  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3408  hypothetical protein  39 
 
 
117 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3076  hypothetical protein  46.75 
 
 
105 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0312486  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4716  hypothetical protein  37.78 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53870  hypothetical protein  35.56 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1343  hypothetical protein  28.3 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0710667  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3411  hypothetical protein  34.41 
 
 
109 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.031686  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0148  putative iron uptake protein  39.51 
 
 
115 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.157544 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1221  hypothetical protein  31.52 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>