19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2314 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2033  hypothetical protein  95.48 
 
 		 620 aa  1179    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0461575  hitchhiker  0.0000553349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2430  response regulator receiver protein  100 
 
 		 619 aa  1254    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.450868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1891  hypothetical protein  57.23 
 
 		 635 aa  665    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.724529 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2087  hypothetical protein  57.17 
 
 		 635 aa  672    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1946  response regulator receiver protein  56.46 
 
 		 646 aa  673    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2031  response regulator receiver protein  95.65 
 
 		 620 aa  1153    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1931  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  59.07 
 
 		 583 aa  660    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2314  response regulator receiver protein  100 
 
 		 619 aa  1254    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2437  hypothetical protein  55.63 
 
 		 631 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2582  response regulator receiver protein  39.4 
 
 		 577 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0740866  hitchhiker  0.000257822 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2023  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 582 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2373  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  36.9 
 
 		 580 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2086  hypothetical protein  35.17 
 
 		 591 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.869328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2191  hypothetical protein  36.89 
 
 		 600 aa  317  4e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000298084  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1894  hypothetical protein  34.96 
 
 		 583 aa  267  5e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.910891  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1850  hypothetical protein  29.64 
 
 		 554 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.543722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1708  oligopeptidase A  40 
 
 		 675 aa  48.5  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0475458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3306  peptidyl-dipeptidase Dcp  25.17 
 
 		 711 aa  45.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4649  oligopeptidase A  24.79 
 
 		 701 aa  44.3  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.621087  normal  0.228337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>