More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_28540 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_28540  LSU ribosomal protein L34P  100 
 
 		 44 aa  85.5  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000649644  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2414  ribosomal protein L34  81.82 
 
 		 44 aa  71.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00945499  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1568  50S ribosomal protein L34  84.09 
 
 		 47 aa  69.3  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0660974  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  67.8  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3034  ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  67.4  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3489  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4623  50S ribosomal protein L34P  79.55 
 
 		 44 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1540  ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000041199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0134  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 52 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52480  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  66.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2199  ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000155667  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4116  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0205607  normal  0.0561719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4908  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 		 44 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6059  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0823674  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5615  ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5137  50S ribosomal protein L34  77.27 
 
 		 44 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0009  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0002  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4143  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3545  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4388  ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000381173 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2038  ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  64.7  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5015  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2603  ribosomal protein L34  76.74 
 
 		 46 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15416  normal  0.859083 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4796  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6371  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4245  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  64.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000109099  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2558  ribosomal protein L34  76.74 
 
 		 45 aa  64.3  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000028537  normal  0.271528 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4028  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.105181  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5675  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5639  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5341  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000589989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5185  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5615  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5738  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0731881  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5320  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5281  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf883  ribosomal protein L34  75 
 
 		 48 aa  64.3  0.0000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5598  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0709  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 48 aa  63.5  0.0000000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0001  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.549372  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3117  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 47 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000116193  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0521  ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  63.2  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.907647  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0220  50S ribosomal protein L34P  72.09 
 
 		 51 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0096  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 52 aa  62.8  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605951 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3434  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3461  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0132  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  62.8  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3760  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2161  50S ribosomal protein L34  73.81 
 
 		 45 aa  62.8  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0656  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 50 aa  62.4  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244963 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3463  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00766604  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1059  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.202626  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2720  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.054761 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4370  ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  62  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.09492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0070  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0031  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 46 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  0.196138 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2088  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0081  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1543  ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 52 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.185024 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0374  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136246  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2065  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  62  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000217746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3562  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  62  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1787  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0214193  normal  0.25456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7100  ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 47 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.161616  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0082  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.376077 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4038  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 46 aa  61.6  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.34188  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0097  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3321  50S ribosomal protein L34P  74.42 
 
 		 44 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3828  50S ribosomal protein L34P  76.19 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0279  ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 52 aa  61.6  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2884  50S ribosomal protein L34  76.74 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715219  normal  0.406653 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3946  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2763  ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 52 aa  60.8  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000022911  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2524  ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 53 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.480913  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1021  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.797032  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9056  ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 45 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00101546  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0035  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.766539  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2147  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  2.00251e-17  unclonable  0.00000111229 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4204  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000294632  decreased coverage  0.00182284 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2827  50S ribosomal protein L34P  72.73 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5302  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0036  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.398714 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0001  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283755  hitchhiker  0.00000000552795 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0962  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0002  50S ribosomal protein L34  75 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000727123  unclonable  0.0000468434 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2950  ribosomal protein L34  76.74 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000318423  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2310  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093766 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4618  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 46 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2138  ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2632  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2353  50S ribosomal protein L34  74.42 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.15509 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1055  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 51 aa  60.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38060  LSU ribosomal protein L34P  71.43 
 
 		 49 aa  60.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1944  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00370795  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1363  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2414  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000429596  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5111  50S ribosomal protein L34  70.73 
 
 		 45 aa  60.1  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0480023  unclonable  0.0000000124693 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3730  ribosomal protein L34  71.43 
 
 		 49 aa  60.1  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.458139 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27040  LSU ribosomal protein L34P  65.12 
 
 		 45 aa  60.5  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>