22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26040 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_26040  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  506  9.999999999999999e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.419278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  39.27 
 
 		 523 aa  106  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2640  hypothetical protein  35.1 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0331835 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13980  hypothetical protein  60 
 
 		 40 aa  57.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1756  hypothetical protein  24.27 
 
 		 683 aa  47.4  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  67.74 
 
 		 580 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2409  hypothetical protein  32.61 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  65.62 
 
 		 2914 aa  44.7  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  55.56 
 
 		 478 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  66.67 
 
 		 813 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  55.56 
 
 		 481 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  68.57 
 
 		 842 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  55 
 
 		 645 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  59.18 
 
 		 706 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  69.7 
 
 		 585 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  69.44 
 
 		 1168 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  60.98 
 
 		 936 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  51.72 
 
 		 643 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  53.49 
 
 		 689 aa  42.7  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  60.47 
 
 		 748 aa  42  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  69.7 
 
 		 835 aa  42  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  69.7 
 
 		 712 aa  42  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>