40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09540 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_09540  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0127203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07580  tRNA-Asn  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.16811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0023  tRNA-Asn  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0800816  normal  0.0382047 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0017  tRNA-Asn  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0033  tRNA-Asn  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0102741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0046  tRNA-Asn  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000438638  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0039  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268211  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0027  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103485  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0027  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0226012  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0053  tRNA-Asn  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0280094  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0043  tRNA-Asn  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0075  tRNA-Asn  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000782806  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  89.8 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00645597  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0008  tRNA-Asn  84.72 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0055  tRNA-Asn  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0338402  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0010  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00716617  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0041  tRNA-Asn  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0018  tRNA-Asn  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.723624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0041  tRNA-Asn  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000401156  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0047  tRNA-Asn  84.85 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000000251185  normal  0.812325 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0013  tRNA-Asn  84.85 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00234115  normal  0.764739 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0008  tRNA-Asn  84.85 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0851483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0014  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.11083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0005  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.570068 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_714  tRNA-Asn  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0692708  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0015  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0022  tRNA-Asn  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.275054  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0013  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAsnVIMSS1309370  tRNA-Asn  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAsnVIMSS1309217  tRNA-Asn  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0011  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36604 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0075  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0888868  normal  0.929022 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0030  tRNA-Asn  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693953  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03470  tRNA-Gln  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.886428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0682  tRNA-Asn  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000249623  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0649  tRNA-Asn  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000525296  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0028  tRNA-Asn  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246384  normal  0.65431 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0007  tRNA-Asn  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Met-2  tRNA-Met  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000219086  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0034    96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.025116  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>