25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2697 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2697  FMN-binding domain-containing protein  100 
 
 
304 aa  620  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.535417  normal  0.011631 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2136  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  39.42 
 
 
211 aa  62  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000237861  normal  0.896446 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14330  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  39.78 
 
 
186 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000378736  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12153  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  25.91 
 
 
248 aa  56.6  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0081  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.92 
 
 
193 aa  55.8  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0628211  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2180  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  26.92 
 
 
244 aa  53.1  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  28.91 
 
 
201 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2383  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  33.33 
 
 
208 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0308  FMN-binding domain-containing protein  26.95 
 
 
199 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0470915  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1531  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.43 
 
 
181 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00374795  normal  0.943593 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.56 
 
 
580 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1799  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  29.45 
 
 
258 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.08 
 
 
368 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1382  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33 
 
 
190 aa  47  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000652446  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.28 
 
 
344 aa  46.6  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2538  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  38.81 
 
 
247 aa  46.2  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.645341  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0702  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.41 
 
 
224 aa  45.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0678  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.41 
 
 
224 aa  45.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0630  FMN-binding domain-containing protein  27.52 
 
 
202 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.033917  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1735  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.4 
 
 
190 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3196  RnfA-Nqr electron transport subunit  30.77 
 
 
220 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.401599  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.67 
 
 
177 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  23.46 
 
 
185 aa  44.3  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0520  FMN-binding domain-containing protein  25.73 
 
 
191 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.273649 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0651  FMN-binding domain-containing protein  28.24 
 
 
203 aa  42.4  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.330764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>