12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0515 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0515  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  815    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.968569  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2862  hypothetical protein  30.66 
 
 
419 aa  159  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0121665  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0972  hypothetical protein  28.53 
 
 
516 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0106696 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0651  hypothetical protein  29.35 
 
 
424 aa  143  6e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.212373 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0625  hypothetical protein  24.92 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0669  hypothetical protein  23.75 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1940  hypothetical protein  24.09 
 
 
341 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0499  hypothetical protein  23.56 
 
 
340 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.508303 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0609  hypothetical protein  22.52 
 
 
339 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0189  hypothetical protein  20.5 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0604161  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6675  hypothetical protein  25.56 
 
 
342 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3020  hypothetical protein  27.73 
 
 
348 aa  42.7  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>