19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3140 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3140  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  621  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.347531  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3326  hypothetical protein  75.32 
 
 		 308 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3673  hypothetical protein  75.33 
 
 		 304 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0627  hypothetical protein  72.9 
 
 		 310 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2121  hypothetical protein  57.14 
 
 		 298 aa  362  6e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.608641  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2238  hypothetical protein  57.14 
 
 		 298 aa  362  6e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.578403  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2107  NERD domain protein  57.14 
 
 		 298 aa  362  6e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.661217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2354  NERD domain-containing protein  56.8 
 
 		 298 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.941853  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0784  hypothetical protein  78.1 
 
 		 136 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3797  hypothetical protein  72.22 
 
 		 138 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3609  hypothetical protein  40.76 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0788453  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3205  hypothetical protein  66.96 
 
 		 134 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2685  NERD domain-containing protein  29.72 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00601782  normal  0.186015 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3235  NERD domain protein  28.45 
 
 		 254 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000235763  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1095  NERD domain-containing protein  25.29 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00991797  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0264  hypothetical protein  26.36 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.8207  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1330  NERD domain protein  33.33 
 
 		 540 aa  54.3  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2293  NERD domain protein  33.33 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2537  NERD domain-containing protein  25.13 
 
 		 290 aa  42.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320376  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>