30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2565 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2565  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  176  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03929  hypothetical protein  71.95 
 
 		 94 aa  127  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1788  hypothetical protein  71.95 
 
 		 83 aa  127  6e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.532232  normal  0.309695 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06893  hypothetical protein  72.84 
 
 		 83 aa  122  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0869  hypothetical protein  74.67 
 
 		 83 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2352  hypothetical protein  70 
 
 		 83 aa  117  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182131 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1716  hypothetical protein  67.9 
 
 		 159 aa  116  9e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1609  hypothetical protein  65.82 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1995  hypothetical protein  66.67 
 
 		 157 aa  113  8.999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3692  hypothetical protein  69.74 
 
 		 81 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.647054  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1266  hypothetical protein  64.56 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.212211 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2108  hypothetical protein  65.85 
 
 		 91 aa  107  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0316  hypothetical protein  67.14 
 
 		 70 aa  100  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04861  hypothetical protein  65.57 
 
 		 78 aa  94.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1384  hypothetical protein  63.51 
 
 		 79 aa  94  6e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0454  hypothetical protein  58.11 
 
 		 96 aa  93.2  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.363875  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07510  hypothetical protein  55.84 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04451  hypothetical protein  62.3 
 
 		 78 aa  88.6  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0750261  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04761  hypothetical protein  63.93 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.109764  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0421  hypothetical protein  63.93 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.459655  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0724  hypothetical protein  63.93 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15621  hypothetical protein  63.93 
 
 		 85 aa  87  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.843222  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4463  hypothetical protein  63.93 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2906  hypothetical protein  62.9 
 
 		 84 aa  84.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000808299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5347  hypothetical protein  51.22 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1058  hypothetical protein  53.52 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3743  hypothetical protein  52.24 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1305  hypothetical protein  56.45 
 
 		 72 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.773936  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0033  hypothetical protein  33.93 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00113494  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2361  hypothetical protein  27.14 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.276355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>