29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1305 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1305  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  150  5e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.773936  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07510  hypothetical protein  63.64 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1609  hypothetical protein  61.67 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0869  hypothetical protein  53.85 
 
 
83 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1716  hypothetical protein  55.74 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2108  hypothetical protein  53.12 
 
 
91 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06893  hypothetical protein  53.85 
 
 
83 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0454  hypothetical protein  54.84 
 
 
96 aa  73.6  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.363875  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2565  hypothetical protein  56.45 
 
 
84 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1995  hypothetical protein  59.26 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1266  hypothetical protein  58.93 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.212211 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0724  hypothetical protein  55 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5347  hypothetical protein  52.94 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15621  hypothetical protein  55 
 
 
85 aa  71.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.843222  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03929  hypothetical protein  56.36 
 
 
94 aa  70.1  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1058  hypothetical protein  58.33 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1788  hypothetical protein  54.39 
 
 
83 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.532232  normal  0.309695 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1384  hypothetical protein  54.24 
 
 
79 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7363  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2352  hypothetical protein  54.39 
 
 
83 aa  67.8  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182131 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3692  hypothetical protein  53.57 
 
 
81 aa  67.8  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.647054  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04861  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04451  hypothetical protein  49.15 
 
 
78 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0750261  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04761  hypothetical protein  49.15 
 
 
78 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.109764  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0421  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.459655  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4463  hypothetical protein  50.85 
 
 
84 aa  64.3  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991028  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2906  hypothetical protein  52.63 
 
 
84 aa  64.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000808299 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0316  hypothetical protein  56.86 
 
 
70 aa  63.9  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3743  hypothetical protein  45.71 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0033  hypothetical protein  34.62 
 
 
75 aa  44.3  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00113494  normal  0.0729977 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>