44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1566 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_1566  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
140 aa  287  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0760824  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2124  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.39 
 
 
139 aa  199  8e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0194253  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0886  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.42 
 
 
139 aa  186  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1078  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.85 
 
 
138 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3586  glyoxalase family protein  57.66 
 
 
138 aa  184  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3280  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.85 
 
 
138 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0562613 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1009  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.85 
 
 
138 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1111  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.85 
 
 
138 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00744956 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3178  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60 
 
 
138 aa  183  9e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3081  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.39 
 
 
138 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0448436  normal  0.495021 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2789  glyoxalase family protein  61.31 
 
 
142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1016  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.39 
 
 
138 aa  181  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144748  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0992  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.97 
 
 
139 aa  181  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0913  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.25 
 
 
140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.943234 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3000  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.2 
 
 
138 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0247436  normal  0.442163 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1045  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.35 
 
 
139 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.702459 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001042  lactoylglutathione lyase  52.59 
 
 
139 aa  164  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04755  lactoylglutathione lyase  54.07 
 
 
139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0088  glyoxalase family protein  51.82 
 
 
138 aa  159  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4210  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.61 
 
 
152 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2495  hypothetical protein  32.86 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2166  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.34 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0593975  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3747  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.75 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0389  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.13 
 
 
131 aa  48.9  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.258603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0969  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.387103  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.73 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130657  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2033  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.17 
 
 
137 aa  43.5  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.543398  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1487  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.29 
 
 
201 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0145  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.36 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.35 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136753  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2806  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.23 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6102  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.614364 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1001  extradiol ring-cleaving dioxygenase, putative  31.3 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0943  putative extradiol ring-cleaving dioxygenase  31.3 
 
 
128 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.37 
 
 
134 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.35 
 
 
131 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0261666  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.59 
 
 
204 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.281044  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1574  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.46 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166496  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.23 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.823568  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2229  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.23 
 
 
172 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6515  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  21.43 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0440  lactoylglutathione lyase  29.1 
 
 
126 aa  40.4  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281062  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1581  glyoxalase family protein  27.78 
 
 
127 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0165  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0300216  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>