15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2604 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2564  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2617  hypothetical protein  98.61 
 
 
122 aa  150  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112803 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2728  hypothetical protein  98.61 
 
 
122 aa  150  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325382  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2604  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  150  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2093  hypothetical protein  51.39 
 
 
133 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3260  putative cytoplasmic protein  57.75 
 
 
119 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3854  putative cytoplasmic protein  45.21 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587296  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0467  putative cytoplasmic protein  45.21 
 
 
122 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1774  hypothetical protein  38.37 
 
 
697 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.426003  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1742  hypothetical protein  42.31 
 
 
242 aa  48.9  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000391702  normal  0.143297 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2024  hypothetical protein  40.38 
 
 
242 aa  47  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0118072  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  33.8 
 
 
1008 aa  44.3  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  33.8 
 
 
1008 aa  44.3  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1345  hypothetical protein  36.54 
 
 
240 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0532  hypothetical protein  40.82 
 
 
241 aa  41.6  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000569067  unclonable  0.00000000103423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>