26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1995 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1995  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  130  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.713597 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2066  hypothetical protein  90.48 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85363  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01808  hypothetical protein  90.48 
 
 
63 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01796  hypothetical protein  90.48 
 
 
63 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2570  hypothetical protein  90.48 
 
 
63 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.602655  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1350  hypothetical protein  90.48 
 
 
63 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.149922 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1805  protein of unknown function DUF1482  88.89 
 
 
91 aa  122  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0478012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2105  hypothetical protein  88.89 
 
 
91 aa  122  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0609353  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1795  hypothetical protein  87.3 
 
 
91 aa  121  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0443619 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1928  hypothetical protein  85.71 
 
 
91 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2407  hypothetical protein  79.37 
 
 
63 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2135  protein of unknown function DUF1482  66.67 
 
 
63 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1847  hypothetical protein  66.67 
 
 
63 aa  98.6  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2837  hypothetical protein  68.85 
 
 
63 aa  96.3  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902868 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2080  protein of unknown function DUF1482  63.49 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2054  hypothetical protein  97.73 
 
 
44 aa  93.6  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.269876  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1279  hypothetical protein  97.73 
 
 
44 aa  93.6  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0886108  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1462  hypothetical protein  97.73 
 
 
44 aa  93.6  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.667158  normal  0.20078 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1991  hypothetical protein  95.45 
 
 
44 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292474 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1839  protein of unknown function DUF1482  58.06 
 
 
63 aa  87.8  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1153  hypothetical protein  40 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000165058  hitchhiker  1.09594e-18 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1782  hypothetical protein  39.66 
 
 
63 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.430243  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1252  hypothetical protein  40.82 
 
 
63 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00282062  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1746  hypothetical protein  40.82 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000344954  decreased coverage  0.0000110997 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2814  hypothetical protein  36.17 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00286267  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2283  hypothetical protein  40.82 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000794088  decreased coverage  2.9029200000000004e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>