27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1350 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2066  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  133  9e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85363  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01808  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01796  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2570  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.602655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1350  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.149922 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1805  protein of unknown function DUF1482  98.41 
 
 		 91 aa  130  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0478012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2105  hypothetical protein  98.41 
 
 		 91 aa  130  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0609353  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1795  hypothetical protein  96.83 
 
 		 91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0443619 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1928  hypothetical protein  95.24 
 
 		 91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1995  hypothetical protein  90.48 
 
 		 63 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.713597 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2407  hypothetical protein  80.95 
 
 		 63 aa  114  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2135  protein of unknown function DUF1482  69.84 
 
 		 63 aa  99.4  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1847  hypothetical protein  69.84 
 
 		 63 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2837  hypothetical protein  72.13 
 
 		 63 aa  99  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902868 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2080  protein of unknown function DUF1482  61.9 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1839  protein of unknown function DUF1482  61.29 
 
 		 63 aa  87.8  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2054  hypothetical protein  84.09 
 
 		 44 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.269876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1279  hypothetical protein  84.09 
 
 		 44 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0886108  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1462  hypothetical protein  84.09 
 
 		 44 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.667158  normal  0.20078 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1991  hypothetical protein  81.82 
 
 		 44 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1153  hypothetical protein  40 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000165058  hitchhiker  1.09594e-18 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1782  hypothetical protein  39.66 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.430243  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1252  hypothetical protein  40.82 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00282062  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1746  hypothetical protein  40.82 
 
 		 63 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000344954  decreased coverage  0.0000110997 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2283  hypothetical protein  40.82 
 
 		 63 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000794088  decreased coverage  2.9029200000000004e-18 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2067  protein of unknown function DUF1482  37.93 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00317505  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2055  hypothetical protein  37.93 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0289214  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>