20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2135 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2135  protein of unknown function DUF1482  100 
 
 
63 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1847  hypothetical protein  96.83 
 
 
63 aa  130  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1795  hypothetical protein  69.84 
 
 
91 aa  101  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0443619 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1805  protein of unknown function DUF1482  69.84 
 
 
91 aa  100  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0478012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2105  hypothetical protein  69.84 
 
 
91 aa  100  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0609353  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2066  hypothetical protein  69.84 
 
 
91 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85363  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1350  hypothetical protein  69.84 
 
 
63 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.149922 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1928  hypothetical protein  68.25 
 
 
91 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2570  hypothetical protein  69.84 
 
 
63 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.602655  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01796  hypothetical protein  69.84 
 
 
63 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01808  hypothetical protein  69.84 
 
 
63 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1995  hypothetical protein  66.67 
 
 
63 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.713597 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2407  hypothetical protein  65.08 
 
 
63 aa  97.8  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2080  protein of unknown function DUF1482  66.67 
 
 
66 aa  96.7  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1839  protein of unknown function DUF1482  61.29 
 
 
63 aa  87.4  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2837  hypothetical protein  63.93 
 
 
63 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902868 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2054  hypothetical protein  65.85 
 
 
44 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.269876  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1279  hypothetical protein  65.85 
 
 
44 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0886108  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1462  hypothetical protein  65.85 
 
 
44 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.667158  normal  0.20078 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1991  hypothetical protein  63.41 
 
 
44 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292474 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>