27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1746 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1746  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000344954  decreased coverage  0.0000110997 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2283  hypothetical protein  98.41 
 
 
63 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000794088  decreased coverage  2.9029200000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1252  hypothetical protein  93.65 
 
 
63 aa  126  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00282062  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1782  hypothetical protein  93.65 
 
 
63 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.430243  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2067  protein of unknown function DUF1482  92.06 
 
 
63 aa  122  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00317505  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2055  hypothetical protein  92.06 
 
 
63 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0289214  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01544  predicted protein  92.06 
 
 
63 aa  121  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000121512  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01536  hypothetical protein  92.06 
 
 
63 aa  121  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000987506  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1153  hypothetical protein  85.71 
 
 
63 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000165058  hitchhiker  1.09594e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1140  hypothetical protein  66.67 
 
 
63 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.506417 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1418  hypothetical protein  66.67 
 
 
67 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371114  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2814  hypothetical protein  48.39 
 
 
62 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00286267  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2218  hypothetical protein  46.77 
 
 
62 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00125999  hitchhiker  4.64633e-17 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0778  hypothetical protein  45.16 
 
 
65 aa  55.1  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000435757  hitchhiker  0.000897507 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2407  hypothetical protein  44.9 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2570  hypothetical protein  40.82 
 
 
63 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.602655  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01796  hypothetical protein  40.82 
 
 
63 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2105  hypothetical protein  38.46 
 
 
91 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0609353  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1350  hypothetical protein  40.82 
 
 
63 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.149922 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2066  hypothetical protein  38.46 
 
 
91 aa  41.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85363  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1805  protein of unknown function DUF1482  38.46 
 
 
91 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0478012  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01808  hypothetical protein  40.82 
 
 
63 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1795  hypothetical protein  38.46 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0443619 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1823  hypothetical protein  47.37 
 
 
42 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000115799  hitchhiker  0.0000000000000162357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3176  hypothetical protein  47.37 
 
 
42 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187265  hitchhiker  4.99222e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1995  hypothetical protein  40.82 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.713597 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1928  hypothetical protein  38.46 
 
 
91 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>