15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2471 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2471  tail fiber assembly protein  100 
 
 
121 aa  254  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134956 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1304  tail assembly chaperone gp38  52.21 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0299  tail fiber assembly protein  53.33 
 
 
147 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.728872 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3033  tail fiber assembly protein  52.38 
 
 
147 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000648798 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00846  conserved hypothetical protein  50.48 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00852  hypothetical protein  50.48 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0820  phage tail assembly chaperone gp38  54.95 
 
 
142 aa  111  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2760  tail assembly chaperone gp38  58.02 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000085866 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2490  tail assembly chaperone gp38  46.94 
 
 
210 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0688487  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0915  tail assembly chaperone gp38  37.5 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0182  hypothetical protein  31.93 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3110  tail assembly chaperone gp38  30 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130843  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0692  hypothetical protein  35.37 
 
 
194 aa  48.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0941  putative tail fiber assembly protein  35 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2808  tail assembly chaperone gp38  26.55 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>