21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2315 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2315  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  hitchhiker  0.000000000000558489 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08196  hypothetical protein  36.08 
 
 		 274 aa  149  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000170796  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0261  hypothetical protein  32.05 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0566  hypothetical protein  30.49 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00656687 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2823  hypothetical protein  27.87 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0963  hypothetical protein  25.34 
 
 		 365 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.369617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0798  hypothetical protein  25.26 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1612  hypothetical protein  25.19 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0074  hypothetical protein  26.87 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000070418  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0653  hypothetical protein  25.75 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.395081  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0056  hypothetical protein  25.37 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02980  hypothetical protein  25.39 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1649  hypothetical protein  23.4 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.432038  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1885  hypothetical protein  25.1 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911612 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3495  hypothetical protein  24.64 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0240  hypothetical protein  23.66 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6250  hypothetical protein  28.45 
 
 		 310 aa  52.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4716  hypothetical protein  22.37 
 
 		 321 aa  49.3  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.428888  normal  0.0726517 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2026  hypothetical protein  22.22 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.121874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0027  hypothetical protein  26.17 
 
 		 259 aa  46.6  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1137  hypothetical protein  29.13 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>