14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0668 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0619  heat shock protein DnaJ domain protein  99.49 
 
 
391 aa  770    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.480443 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0678  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  99.74 
 
 
391 aa  772    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0734  heat shock protein DnaJ domain protein  99.74 
 
 
391 aa  772    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6537  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0612  heat shock protein DnaJ domain protein  99.49 
 
 
391 aa  770    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0668  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
391 aa  774    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0372  hypothetical protein  59.01 
 
 
391 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1223  hypothetical protein  59.01 
 
 
391 aa  433  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0440  hypothetical protein  59.01 
 
 
391 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3523  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  54.66 
 
 
391 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.154573 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2468  heat shock protein DnaJ domain protein  26.92 
 
 
338 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3263  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  40.43 
 
 
550 aa  55.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4125  heat shock protein DnaJ domain protein  29.46 
 
 
247 aa  50.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00694826  hitchhiker  0.0000294861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1137  serine/threonine protein kinase  24.85 
 
 
962 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2319  hypothetical protein  25 
 
 
442 aa  42.7  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.722749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>