More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_R0045 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_R0045  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000457584  normal  0.0314224 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0016  tRNA-Ile  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.165023  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0035  tRNA-Ile  98.63 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1610  tRNA-Ile  98.63 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0003  tRNA-Ile  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00141383  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0010  tRNA-Ile  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0680971  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0018  tRNA-Ile  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0178227  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0025  tRNA-Ile  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0236183  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0081  tRNA-Ile  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149599  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0054  tRNA-Ile  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000202607  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0022  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000998833  hitchhiker  0.000594977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0010  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000315774  hitchhiker  0.000925503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0055  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00629084  normal  0.290237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0079  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000309524  normal  0.0982951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0081  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00202745  normal  0.185006 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0007  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00099613  hitchhiker  0.000158126 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0035  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000956793  normal  0.185983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0009  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0460221  hitchhiker  0.00205125 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0073  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000465984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0002  tRNA-Ile  98.46 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000811561  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0012  tRNA-Ile  98.46 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000226616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0056  tRNA-Ile  98.46 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00138336  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0078  tRNA-Ile  98.46 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000836991  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0086  tRNA-Ile  98.46 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00068353  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0063  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000331537  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0032  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000276963  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0059  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000552358  normal  0.693628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0092  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368423  hitchhiker  0.00436649 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0014  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00192391  hitchhiker  0.00313386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0005  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000179229  normal  0.648072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0098  tRNA-Ile  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000369381  normal  0.163162 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t09  tRNA-Ile  95.71 
 
 		 74 bp  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.630661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t48  tRNA-Ile  95.71 
 
 		 74 bp  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t70  tRNA-Ile  95.71 
 
 		 74 bp  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619158  hitchhiker  0.00932375 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0005  tRNA-Ile  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0019  tRNA-Ile  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0045  tRNA-Ile  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.165882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0063  tRNA-Ile  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60550  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000429447  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t03  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t09  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0116209  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t15  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160114  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t42  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158841  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t63  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.07883  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA14  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0900551  normal  0.0100999 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA5  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA51  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000929539  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA73  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA82  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000191187  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R13  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000158888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R2  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R42  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000533032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R59  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000380652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R80  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887019  hitchhiker  0.00768268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R93  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000022565  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6152  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718757  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5402  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0831781  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0036  tRNA-Ile  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.912426  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4845  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0555625  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0812  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460941  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60090  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270982  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60000  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0181661  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60380  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0553441  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60340  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0530046  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08580  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000150356 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55635  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.269622 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62080  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0500428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70900  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.335626 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60160  tRNA-Ile  95.38 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000736838  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0063  tRNA-Ile  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.809971 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0033  tRNA-Ile  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0046  tRNA-Ile  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0057  tRNA-Ile  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.926394 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0026  tRNA-Ile  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0532408 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0008  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0770657  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0098  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0025  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0513291  unclonable  0.00000384252 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0008  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314854  hitchhiker  0.00756038 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0067  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000189357  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0002  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0365419  normal  0.118397 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t064  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0007  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000911687  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0114  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000347317  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0008  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289136  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0118  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000845195  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0072  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00892637  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0127  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000330359  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0008  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00154963  normal  0.549393 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0070  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000447214  normal  0.107395 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0135  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000335927  normal  0.0144188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0010  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000891119  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0093  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879368  normal  0.134634 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0036  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0271306  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0020  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0504823  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0081  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000962065  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0175  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0770081  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0117  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000183962  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0084  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0017286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0072  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0761618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0009  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>