More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_R0036 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_R0036  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.912426  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0054  tRNA-Ile  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000202607  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0035  tRNA-Ile  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1610  tRNA-Ile  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0055  tRNA-Ile  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0040  tRNA-Ile  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.111959 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0016  tRNA-Ile  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.165023  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0049  tRNA-Ile  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0005  tRNA-Ile  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0019  tRNA-Ile  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0045  tRNA-Ile  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.165882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0063  tRNA-Ile  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0045  tRNA-Ile  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000457584  normal  0.0314224 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0003  tRNA-Ile  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00141383  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0010  tRNA-Ile  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0680971  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0018  tRNA-Ile  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0178227  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0025  tRNA-Ile  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0236183  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0081  tRNA-Ile  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149599  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0002  tRNA-Ile  98.21 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0021  tRNA-Ile  98.21 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0055  tRNA-Ile  98.21 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0078  tRNA-Ile  98.21 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0026  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0532408 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0063  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.809971 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0012  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0033  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0057  tRNA-Ile  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.926394 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0002  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000811561  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0012  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000226616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0056  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00138336  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0078  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000836991  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0086  tRNA-Ile  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00068353  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0002  tRNA-Ile  96.36 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0699442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0009  tRNA-Ile  96.36 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0082  tRNA-Ile  96.36 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0466145  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t09  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.630661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t48  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t70  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619158  hitchhiker  0.00932375 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0005  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000179229  normal  0.648072 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0008  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0055  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00629084  normal  0.290237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0007  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00099613  hitchhiker  0.000158126 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0035  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000956793  normal  0.185983 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0032  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000276963  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0010  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000315774  hitchhiker  0.000925503 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0058  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.102192  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0032  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0059  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000552358  normal  0.693628 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0098  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000369381  normal  0.163162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0079  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000309524  normal  0.0982951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0014  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00192391  hitchhiker  0.00313386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0092  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368423  hitchhiker  0.00436649 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0030  tRNA-Ile  96.23 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0022  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000998833  hitchhiker  0.000594977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0081  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00202745  normal  0.185006 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0026  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0084  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0077  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0029  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.125391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0022  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0223  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0090777  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0547  tRNA-Ile  96.23 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0009  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0460221  hitchhiker  0.00205125 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0006  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293878 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0040  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.443427  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0063  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000331537  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0073  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000465984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0037  tRNA-Ile  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0051  tRNA-Ile  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0042  tRNA-Ile  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0003  tRNA-Ile  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6007  tRNA-Ile  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.358731 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_R0064  tRNA-Ile  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.375989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0049  tRNA-Ile  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.319822 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0064  tRNA-Ile  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0066  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0066  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6014  tRNA-Ile  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4324  tRNA-Ile  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0101134  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4348  tRNA-Ile  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.265257  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4353  tRNA-Ile  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0058  tRNA-Ile  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0050  tRNA-Ile  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303318 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0056  tRNA-Ile  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0018  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.891633  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0085  tRNA-Ile  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0058  tRNA-Ile  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.646695 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0064  tRNA-Ile  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0072  tRNA-Ile  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.152177 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0003  tRNA-Ile  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00132267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0003  tRNA-Ile  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.784686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0062  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0007  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000177312  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  100 
 
 		 80 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  100 
 
 		 80 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000227383  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0014391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000945265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0663179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>