11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3874 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3874  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  377  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.912957  normal  0.123813 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2817  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.508332  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1491  hypothetical protein  32.79 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00278344  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2550  hypothetical protein  27.37 
 
 		 194 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70091  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4794  hypothetical protein  29.48 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1331  hypothetical protein  23.49 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2386  hypothetical protein  41.82 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4901  hypothetical protein  21.92 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03040  hypothetical protein  25.64 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0851  hypothetical protein  23.97 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00740746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13040  hypothetical protein  23.49 
 
 		 255 aa  42.4  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>