12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2520 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2520  NAD+ synthase  100 
 
 		 306 aa  599  1e-170  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2837  hypothetical protein  52.19 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47785  predicted protein  30.4 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.183468  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1598  hypothetical protein  28.75 
 
 		 675 aa  70.1  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000695683  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1750  hypothetical protein  29.43 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489319  normal  0.427262 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2840  hypothetical protein  27.22 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.884921  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0404  hypothetical protein  27.7 
 
 		 776 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321562  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2756  hypothetical protein  36.57 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  25.18 
 
 		 495 aa  49.7  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00791  Rhs family protein  23.89 
 
 		 471 aa  47.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0158611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2538  collagen adhesion protein  35.53 
 
 		 729 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2785  collagen adhesion protein  23.61 
 
 		 731 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>