134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2518 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2518  pseudouridine synthase, RluD  100 
 
 		 201 aa  416  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0180  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.15 
 
 		 200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02764  acyltransferase  44.83 
 
 		 209 aa  161  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229427  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2245  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.09 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0239387  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0168  hypothetical protein  39.78 
 
 		 209 aa  144  9e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0148  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.78 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4020  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.99 
 
 		 210 aa  141  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4196  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.76 
 
 		 192 aa  141  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3630  acyltransferase family protein  42.68 
 
 		 183 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4156  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.18 
 
 		 183 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2191  hypothetical protein  39.35 
 
 		 187 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2219  hypothetical protein  39.35 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0561  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.7 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233184  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4832  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.75 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2254  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.08 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1355  acyltransferase, putative  39.41 
 
 		 176 aa  127  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0124  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.31 
 
 		 187 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4235  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.31 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0119  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.31 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0123  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.31 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1033  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.9 
 
 		 210 aa  124  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0114  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.15 
 
 		 186 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.602427 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0123  acyltransferase family protein  41.78 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2166  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.68 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2093  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  122  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.821432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0120  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.86 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.179228  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0119  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.57 
 
 		 186 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0963438 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0119  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.5 
 
 		 186 aa  122  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038904 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3750  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.07 
 
 		 183 aa  120  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144073 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1712  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.51 
 
 		 205 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10462  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2413  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.8 
 
 		 244 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0451  hypothetical protein  37.06 
 
 		 192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04680  hypothetical protein  37.95 
 
 		 192 aa  117  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4440  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.23 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0088  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.5 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01012  Acyltransferase family protein  36.21 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.501742  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3447  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.42 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37610  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.61 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2670  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.29 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0440614 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1783  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.76 
 
 		 173 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.175926  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3949  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.73 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1051  hypothetical protein  33.91 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.961359 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2802  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.13 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606207  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0958  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.89 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4324  phospholipid/glycerol acyltransferase  34 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.270681 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3457  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.76 
 
 		 199 aa  99  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0632621 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0677  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.78 
 
 		 185 aa  98.2  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0997  acyltransferase family protein  34.55 
 
 		 290 aa  97.8  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195621  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3737  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.15 
 
 		 193 aa  94.7  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0472119 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22670  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.5 
 
 		 197 aa  92  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2517  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.89 
 
 		 201 aa  88.6  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.38065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0195  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.55 
 
 		 172 aa  87.8  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0134  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.73 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1325  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.67 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0488  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.92 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0582  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  32.64 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0216  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  32.64 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0878  phospholipid and glycerol acyltransferase  32.64 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2730  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.64 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.594764  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2348  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.64 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0699  acyltransferase family protein  32.64 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0714  acyltransferase family protein  32.64 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502533  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2428  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.64 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3386  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.37 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000418539  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2756  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.11 
 
 		 254 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0873  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.47 
 
 		 258 aa  50.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000151489  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2731  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.87 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2621  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.11 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.741388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0403  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.87 
 
 		 252 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.355524 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1799  1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase  26.9 
 
 		 271 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6031  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.71 
 
 		 254 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0005  acyltransferase  28.32 
 
 		 257 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2092  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.87 
 
 		 254 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389917  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2704  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.87 
 
 		 254 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130434  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0670  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.29 
 
 		 255 aa  48.9  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.776916  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4015  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.93 
 
 		 252 aa  48.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00060  putative acyltransferase  29.33 
 
 		 257 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2078  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.4 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.1864  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0595  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.71 
 
 		 254 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0074  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.25 
 
 		 261 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000544756 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0684  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.93 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1878  1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase  26.4 
 
 		 271 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3324  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.38 
 
 		 254 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0077  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.25 
 
 		 256 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000191625  decreased coverage  0.0000000000082307 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4060  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.27 
 
 		 241 aa  45.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1439  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.03 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00225818  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0187  hdtS protein  31.51 
 
 		 256 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0413  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.78 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0357  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.67 
 
 		 249 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0937  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferases  27.48 
 
 		 253 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0011  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.67 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1470  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.06 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.151456  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1291  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.08 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302513 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0953  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.21 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0398  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.78 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.330397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0058  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.57 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000912039  unclonable  0.000000385865 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0009  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.66 
 
 		 256 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00250914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5094  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.06 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3378  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.01 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.611462  normal  0.54749 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0192  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.03 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>