More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0058 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0058  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
261 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000912039  unclonable  0.000000385865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0074  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
261 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000185774  normal  0.109161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0074  phospholipid/glycerol acyltransferase  99.23 
 
 
261 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000544756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0077  phospholipid/glycerol acyltransferase  90.23 
 
 
256 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000191625  decreased coverage  0.0000000000082307 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0007  phospholipid/glycerol acyltransferase  81.85 
 
 
274 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000602556  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0187  hdtS protein  79.01 
 
 
256 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0009  phospholipid/glycerol acyltransferase  75.89 
 
 
256 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00250914  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0005  acyltransferase  66.4 
 
 
257 aa  349  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00060  putative acyltransferase  64.29 
 
 
257 aa  343  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0011  phospholipid/glycerol acyltransferase  70.82 
 
 
255 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00080  LPA acyltransferase protein  64.35 
 
 
242 aa  320  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.729238  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0714  acyltransferase family protein  41.67 
 
 
259 aa  198  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502533  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0216  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  41.67 
 
 
259 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0878  phospholipid and glycerol acyltransferase  41.67 
 
 
259 aa  198  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0699  acyltransferase family protein  41.67 
 
 
259 aa  198  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2428  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.67 
 
 
259 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2348  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.67 
 
 
259 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2730  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.67 
 
 
259 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.594764  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2345  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.49 
 
 
240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0582  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  42.62 
 
 
259 aa  195  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0375  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.02 
 
 
270 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0873  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.32 
 
 
258 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000151489  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1223  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.93 
 
 
248 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6169  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4015  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.67 
 
 
252 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066125  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0642  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.91 
 
 
236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0684  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.67 
 
 
252 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357899  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0595  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.67 
 
 
254 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0403  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.08 
 
 
252 aa  188  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.355524 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0548  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.72 
 
 
283 aa  187  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6031  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.5 
 
 
254 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2731  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.04 
 
 
254 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2092  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.04 
 
 
254 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389917  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2704  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.04 
 
 
254 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130434  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0455  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.04 
 
 
251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2756  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.2 
 
 
254 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2573  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.84 
 
 
251 aa  181  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353227 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2621  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.2 
 
 
254 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.741388  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2052  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  41.53 
 
 
249 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1866  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.13 
 
 
244 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3254  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.96 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4200  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.24 
 
 
256 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0009  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.42 
 
 
253 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0957  phospholipid/glycerol acyltransferase  40 
 
 
252 aa  168  6e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0011  Protoheme IX farnesyltransferase  37.8 
 
 
240 aa  168  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3378  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.56 
 
 
254 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.611462  normal  0.54749 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1570  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.65 
 
 
244 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.983241  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0357  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.18 
 
 
249 aa  166  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2584  acyltransferase family protein  40 
 
 
242 aa  166  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2212  phospholipid/glycerol acyltransferase  40 
 
 
242 aa  166  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4243  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.51 
 
 
250 aa  164  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0459048  hitchhiker  0.000000000931416 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0213  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.11 
 
 
254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0954935 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4741  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.62 
 
 
258 aa  161  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0447  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.66 
 
 
255 aa  160  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7109  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.39 
 
 
240 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.135036 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3537  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.04 
 
 
250 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0406833 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2324  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.95 
 
 
254 aa  159  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000640297  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0398  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.89 
 
 
250 aa  158  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.330397  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1291  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.14 
 
 
246 aa  158  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.302513 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0522  putative acyltransferase transmembrane protein  36.48 
 
 
250 aa  156  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00553836 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3693  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.21 
 
 
244 aa  155  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.869858  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0413  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.89 
 
 
250 aa  155  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661287  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0530  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.4 
 
 
249 aa  155  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0626178 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0546  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.59 
 
 
249 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0505  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.04 
 
 
249 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123729  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5696  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.02 
 
 
236 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.226605 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0444  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.84 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4174  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.14 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.969871  normal  0.278578 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2165  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.93 
 
 
283 aa  145  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131735  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1022  putative acyltransferase  38.05 
 
 
236 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508637  normal  0.11203 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0043  acyltransferase family protein  36.02 
 
 
268 aa  139  4.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4864  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.62 
 
 
262 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.238308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0837  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.31 
 
 
269 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2052  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.16 
 
 
257 aa  125  7e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.850396  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3747  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.57 
 
 
244 aa  123  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0236961  normal  0.0298826 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1592  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.75 
 
 
257 aa  122  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1179  putative 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase (plsC)  32.21 
 
 
255 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.68736 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0946  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.01 
 
 
269 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.588556  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0987  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0019  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.21 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.917675  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_002978  WD1149  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase family protein  37.28 
 
 
241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0562446  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0042  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.6 
 
 
240 aa  119  7e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3541  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 
250 aa  118  9e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.203157 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3257  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.16 
 
 
255 aa  115  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1994  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  32.55 
 
 
260 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1920  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.55 
 
 
300 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3562  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.84 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4030  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.09 
 
 
303 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0579  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.33 
 
 
259 aa  112  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5215  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.63 
 
 
269 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0670  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.62 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.776916  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3868  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.75 
 
 
265 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.39528  normal  0.122725 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3575  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.28 
 
 
265 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.614267  normal  0.0350053 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0072  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase family protein  31.78 
 
 
236 aa  105  6e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3412  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.67 
 
 
234 aa  105  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.535491  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2092  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.77 
 
 
263 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0101999  normal  0.0780436 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1538  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.73 
 
 
263 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.011975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1756  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.77 
 
 
263 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0953  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.54 
 
 
244 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3081  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.19 
 
 
232 aa  103  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000000181964  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3088  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.02 
 
 
268 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.895958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>