18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2229 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2229  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  736    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330354 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3631  glycosyl transferase, group 1  45.13 
 
 		 363 aa  289  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190155  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2466  glycosyl transferase group 1  42.35 
 
 		 390 aa  285  5.999999999999999e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2123  glycosyl transferase, group 1  41.18 
 
 		 350 aa  248  8e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.887263  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0516  glycosyl transferase group 1  40.28 
 
 		 360 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.869562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1606  glycosyl transferase, group 1  42.73 
 
 		 357 aa  236  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.444102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1530  glycosyl transferase, group 1  33.85 
 
 		 380 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2035  glycosyltransferase  35.15 
 
 		 390 aa  176  7e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2458  glycosyltransferase-like protein  31.46 
 
 		 378 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1759  glycosyltransferase-like protein  31.82 
 
 		 378 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123674 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2856  glycosyltransferase-like protein  32.03 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2289  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 		 380 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582583 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1696  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1403  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0984  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 		 364 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1483  methyltransferase type 11  26.88 
 
 		 885 aa  52  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0157  hypothetical protein  34.85 
 
 		 357 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0513  glycosyl transferase, group 1  23.12 
 
 		 924 aa  42.7  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>