56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1882 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1882  transcriptional regulatory protein  100 
 
 		 204 aa  424  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.622701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2832  transcriptional regulatory protein  53.17 
 
 		 231 aa  223  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000741342  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1365  hypothetical protein  48.76 
 
 		 198 aa  207  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1361  hypothetical protein  48.76 
 
 		 198 aa  206  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1229  hypothetical protein  48 
 
 		 205 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3447  putative lipoprotein  47.25 
 
 		 197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.002618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1331  hypothetical protein  48.72 
 
 		 205 aa  194  6e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.131922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3324  hypothetical protein  47.94 
 
 		 205 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109882 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3060  hypothetical protein  49.25 
 
 		 205 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2978  hypothetical protein  49.25 
 
 		 205 aa  192  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.294635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3258  hypothetical protein  49.49 
 
 		 217 aa  191  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.077733 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1134  hypothetical protein  49.49 
 
 		 217 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1100  hypothetical protein  49.49 
 
 		 217 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1033  hypothetical protein  49.49 
 
 		 217 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.935593  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1074  hypothetical protein  47.26 
 
 		 205 aa  191  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3158  hypothetical protein  48.74 
 
 		 205 aa  191  8e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191231  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3557  hypothetical protein  48.22 
 
 		 205 aa  187  7e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1038  hypothetical protein  47.69 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1210  hypothetical protein  46.15 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2633  hypothetical protein  50.28 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2230  hypothetical protein  44.39 
 
 		 210 aa  184  6e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0644  putative lipoprotein  46.91 
 
 		 199 aa  183  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1060  hypothetical protein  50.55 
 
 		 203 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1367  putative lipoprotein  46 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1984  lytic transglycosylase catalytic  43.01 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1944  hypothetical protein  45.74 
 
 		 215 aa  178  4e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0808013  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002531  hypothetical protein  44.97 
 
 		 188 aa  177  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03485  hypothetical protein  45.21 
 
 		 187 aa  176  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0984  hypothetical protein  45.74 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00101229  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0430  putative lipoprotein  42.63 
 
 		 192 aa  173  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1205  putative lipoprotein  43.09 
 
 		 194 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1168  putative lipoprotein  43.09 
 
 		 194 aa  173  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0748418  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02762  putative lipoprotein  47.78 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0691373  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1221  hypothetical protein  45.9 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0710  putative lipoprotein  48.21 
 
 		 189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.147777  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3372  putative lipoprotein  49.23 
 
 		 204 aa  171  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3012  transcriptional regulatory protein  45.41 
 
 		 198 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1317  putative lipoprotein  45.65 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1496  hypothetical protein  46.03 
 
 		 193 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0147  hypothetical protein  46.03 
 
 		 193 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.126883 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0062  hypothetical protein  45.98 
 
 		 195 aa  167  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0191236  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4077  putative lipoprotein  50.26 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.364574  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2902  hypothetical protein  44.97 
 
 		 193 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2668  hypothetical protein  41.18 
 
 		 192 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0580276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1881  hypothetical protein  42.94 
 
 		 190 aa  159  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0234  hypothetical protein  41.45 
 
 		 193 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0204  hypothetical protein  41.45 
 
 		 193 aa  157  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2173  hypothetical protein  41.49 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780723  normal  0.253338 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0068  lipoprotein  42.71 
 
 		 194 aa  156  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291944 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0021  hypothetical protein  42.25 
 
 		 212 aa  154  9e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2157  hypothetical protein  41.71 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.563893  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2221  putative transmembrane protein  43.58 
 
 		 189 aa  149  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1048  hypothetical protein  39.36 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3587  hypothetical protein  40.23 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2885  hypothetical protein  36.32 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0501836  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  31.82 
 
 		 1190 aa  42.4  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>