55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0062 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0062  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  407  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0191236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1496  hypothetical protein  69.95 
 
 		 193 aa  267  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0147  hypothetical protein  69.95 
 
 		 193 aa  267  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.126883 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2668  hypothetical protein  64.77 
 
 		 192 aa  264  7e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0580276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2902  hypothetical protein  68.39 
 
 		 193 aa  262  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0068  lipoprotein  64.25 
 
 		 194 aa  255  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291944 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0430  putative lipoprotein  62.18 
 
 		 192 aa  249  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3447  putative lipoprotein  52.66 
 
 		 197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.002618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1331  hypothetical protein  46.88 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.131922 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1074  hypothetical protein  46.84 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1229  hypothetical protein  46.07 
 
 		 205 aa  185  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1033  hypothetical protein  46.28 
 
 		 217 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.935593  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1038  hypothetical protein  45.83 
 
 		 205 aa  184  8e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1134  hypothetical protein  45.74 
 
 		 217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1210  hypothetical protein  45.26 
 
 		 205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1100  hypothetical protein  45.74 
 
 		 217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3258  hypothetical protein  45.74 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.077733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3324  hypothetical protein  44.44 
 
 		 205 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109882 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2230  hypothetical protein  47.06 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2978  hypothetical protein  44.5 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.294635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3158  hypothetical protein  43.98 
 
 		 205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3060  hypothetical protein  43.98 
 
 		 205 aa  178  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3557  hypothetical protein  44.44 
 
 		 205 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1060  hypothetical protein  46.86 
 
 		 203 aa  177  8e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1365  hypothetical protein  45.95 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1361  hypothetical protein  45.41 
 
 		 198 aa  171  7.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2633  hypothetical protein  44.89 
 
 		 206 aa  167  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1944  hypothetical protein  45.6 
 
 		 215 aa  166  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0808013  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1221  hypothetical protein  44.94 
 
 		 228 aa  166  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1367  putative lipoprotein  41.75 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02762  putative lipoprotein  44.5 
 
 		 212 aa  165  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0691373  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3012  transcriptional regulatory protein  45.71 
 
 		 198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2832  transcriptional regulatory protein  44.21 
 
 		 231 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000741342  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2173  hypothetical protein  45.56 
 
 		 234 aa  163  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780723  normal  0.253338 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0710  putative lipoprotein  47.67 
 
 		 189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.147777  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002531  hypothetical protein  44.51 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03485  hypothetical protein  45.56 
 
 		 187 aa  162  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1882  transcriptional regulatory protein  45.26 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.622701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1881  hypothetical protein  45.45 
 
 		 190 aa  159  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1205  putative lipoprotein  43.94 
 
 		 194 aa  156  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1168  putative lipoprotein  43.43 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0748418  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0204  hypothetical protein  41.75 
 
 		 193 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0234  hypothetical protein  41.75 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1984  lytic transglycosylase catalytic  42.42 
 
 		 194 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4077  putative lipoprotein  41.58 
 
 		 206 aa  151  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.364574  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3372  putative lipoprotein  42.71 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3587  hypothetical protein  46.51 
 
 		 194 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0984  hypothetical protein  43.93 
 
 		 218 aa  147  7e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00101229  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1048  hypothetical protein  42.94 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0644  putative lipoprotein  39.89 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1317  putative lipoprotein  43.26 
 
 		 196 aa  142  4e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0021  hypothetical protein  41.71 
 
 		 212 aa  140  8e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2221  putative transmembrane protein  43.65 
 
 		 189 aa  140  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2157  hypothetical protein  41.14 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.563893  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2885  hypothetical protein  40.24 
 
 		 209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0501836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>