55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02762 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02762  putative lipoprotein  100 
 
 
212 aa  442  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0691373  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1367  putative lipoprotein  73.23 
 
 
218 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3258  hypothetical protein  66 
 
 
217 aa  280  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.077733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1033  hypothetical protein  68.42 
 
 
217 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.935593  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1100  hypothetical protein  67.89 
 
 
217 aa  278  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1134  hypothetical protein  67.89 
 
 
217 aa  278  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4077  putative lipoprotein  72.25 
 
 
206 aa  277  7e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.364574  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1229  hypothetical protein  63.37 
 
 
205 aa  275  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3557  hypothetical protein  63.82 
 
 
205 aa  275  5e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3158  hypothetical protein  63.82 
 
 
205 aa  275  5e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191231  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3324  hypothetical protein  58.82 
 
 
205 aa  274  7e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109882 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3060  hypothetical protein  63.32 
 
 
205 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2978  hypothetical protein  63.32 
 
 
205 aa  272  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.294635  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1210  hypothetical protein  62.76 
 
 
205 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1074  hypothetical protein  61.76 
 
 
205 aa  270  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1331  hypothetical protein  60.89 
 
 
205 aa  270  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.131922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3012  transcriptional regulatory protein  66.85 
 
 
198 aa  267  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1038  hypothetical protein  60.2 
 
 
205 aa  263  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1221  hypothetical protein  65.24 
 
 
228 aa  263  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1060  hypothetical protein  63.3 
 
 
203 aa  258  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3372  putative lipoprotein  58.17 
 
 
204 aa  238  6.999999999999999e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2633  hypothetical protein  54.84 
 
 
206 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002531  hypothetical protein  55.56 
 
 
188 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03485  hypothetical protein  53.72 
 
 
187 aa  211  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1944  hypothetical protein  52.06 
 
 
215 aa  208  4e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0808013  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0644  putative lipoprotein  51.96 
 
 
199 aa  206  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3447  putative lipoprotein  46.52 
 
 
197 aa  181  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.002618  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1365  hypothetical protein  45.21 
 
 
198 aa  180  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2832  transcriptional regulatory protein  47.18 
 
 
231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000741342  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1361  hypothetical protein  44.68 
 
 
198 aa  178  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2668  hypothetical protein  47.67 
 
 
192 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0580276  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2230  hypothetical protein  45.36 
 
 
210 aa  176  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0710  putative lipoprotein  48.85 
 
 
189 aa  169  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.147777  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0984  hypothetical protein  45.56 
 
 
218 aa  167  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00101229  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0430  putative lipoprotein  43.01 
 
 
192 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2173  hypothetical protein  44.09 
 
 
234 aa  166  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780723  normal  0.253338 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0147  hypothetical protein  43.92 
 
 
193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.126883 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1496  hypothetical protein  43.92 
 
 
193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2902  hypothetical protein  43.39 
 
 
193 aa  161  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1048  hypothetical protein  43.78 
 
 
248 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1882  transcriptional regulatory protein  47.78 
 
 
204 aa  159  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.622701  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2885  hypothetical protein  45.11 
 
 
209 aa  158  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0501836  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0062  hypothetical protein  45.76 
 
 
195 aa  157  8e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0191236  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1984  lytic transglycosylase catalytic  42.78 
 
 
194 aa  154  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0068  lipoprotein  45.74 
 
 
194 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1881  hypothetical protein  44.94 
 
 
190 aa  151  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0021  hypothetical protein  42.16 
 
 
212 aa  149  4e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1205  putative lipoprotein  40.82 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1168  putative lipoprotein  41.33 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0748418  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2157  hypothetical protein  41.62 
 
 
212 aa  145  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.563893  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0234  hypothetical protein  43.59 
 
 
193 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1317  putative lipoprotein  39.25 
 
 
196 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0204  hypothetical protein  43.08 
 
 
193 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2221  putative transmembrane protein  43.09 
 
 
189 aa  139  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3587  hypothetical protein  44.63 
 
 
194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>