55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0875 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0875  hypothetical protein  100 
 
 		 842 aa  1716    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0738842 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0779  hypothetical protein  38.58 
 
 		 766 aa  514  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0816  hypothetical protein  37.53 
 
 		 751 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58690  hypothetical protein  39.2 
 
 		 751 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.544037 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5140  hypothetical protein  38.31 
 
 		 749 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0949  hypothetical protein  36.84 
 
 		 751 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0786  hypothetical protein  34.5 
 
 		 729 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341709 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0953  hypothetical protein  33.71 
 
 		 766 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596872  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2314  hypothetical protein  31.76 
 
 		 735 aa  372  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0822  hypothetical protein  33.99 
 
 		 719 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0788  hypothetical protein  32.61 
 
 		 745 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0811  hypothetical protein  33.09 
 
 		 717 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.083655  normal  0.106889 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2114  hypothetical protein  29.54 
 
 		 787 aa  348  3e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190473  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4406  hypothetical protein  33.29 
 
 		 721 aa  332  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0751  hypothetical protein  33.05 
 
 		 763 aa  294  5e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2241  hypothetical protein  29.35 
 
 		 782 aa  283  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0764  hypothetical protein  28.62 
 
 		 781 aa  258  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3053  hypothetical protein  30.33 
 
 		 732 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0699  protein of unknown function DUF1631  25.55 
 
 		 773 aa  204  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.268383  normal  0.290029 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0820  cell division protein FtsZ  23.54 
 
 		 764 aa  204  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04577  hypothetical protein  24.82 
 
 		 763 aa  200  9e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2129  hypothetical protein  23.31 
 
 		 744 aa  148  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.796066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1435  hypothetical protein  25.75 
 
 		 771 aa  146  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.26 
 
 		 1249 aa  138  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02373  hypothetical protein  29.3 
 
 		 802 aa  106  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2229  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1201 aa  105  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.186545  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0279  hypothetical protein  23.35 
 
 		 773 aa  103  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0968275 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0346  hypothetical protein  26.59 
 
 		 850 aa  102  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198379 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0761  hypothetical protein  28.3 
 
 		 828 aa  91.7  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4133  hypothetical protein  28.78 
 
 		 687 aa  91.7  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0836  hypothetical protein  24.8 
 
 		 801 aa  88.6  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4642  hypothetical protein  24.5 
 
 		 795 aa  87  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3864  hypothetical protein  23.2 
 
 		 790 aa  87  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4085  hypothetical protein  27.04 
 
 		 784 aa  86.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0688006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1247  hypothetical protein  21.94 
 
 		 782 aa  83.2  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2088  hypothetical protein  38.54 
 
 		 524 aa  82.4  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721008 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3353  hypothetical protein  24.21 
 
 		 784 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.739095  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2036  hypothetical protein  31.94 
 
 		 473 aa  79.7  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3274  protein of unknown function DUF1631  29.41 
 
 		 760 aa  80.1  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4003  hypothetical protein  24.21 
 
 		 784 aa  79.7  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2170  hypothetical protein  22.43 
 
 		 737 aa  79  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0848  hypothetical protein  25.59 
 
 		 824 aa  77  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4528  hypothetical protein  21.68 
 
 		 854 aa  75.1  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3883  hypothetical protein  24.15 
 
 		 780 aa  73.9  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5117  protein of unknown function DUF1631  22.58 
 
 		 804 aa  71.2  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4760  hypothetical protein  22.92 
 
 		 447 aa  69.7  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22061  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0847  hypothetical protein  22.92 
 
 		 890 aa  69.3  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4643  hypothetical protein  21.6 
 
 		 810 aa  62.4  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.43497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0851  hypothetical protein  25.88 
 
 		 445 aa  60.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.509842  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0969  hypothetical protein  25.88 
 
 		 445 aa  59.7  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.852631  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0429  hypothetical protein  22.02 
 
 		 727 aa  58.2  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.9239 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2151  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  18.61 
 
 		 1072 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439713  normal  0.242332 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1544  hypothetical protein  35.56 
 
 		 608 aa  54.3  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.787123  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2904  hypothetical protein  21.36 
 
 		 867 aa  49.7  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  33.71 
 
 		 269 aa  45.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.37426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>