31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0423 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0423  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  532  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0732  hypothetical protein  60.42 
 
 		 251 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1663  hypothetical protein  46.41 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2610  hypothetical protein  36.44 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0106  hypothetical protein  35.9 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105806 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4096  hypothetical protein  33.47 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541182 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3892  hypothetical protein  33.47 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0302  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.93 
 
 		 243 aa  125  5e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.04779  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1803  dTDP-glucose pyrophosphorylase  31.97 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1800  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.83 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.6322  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2595  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.92 
 
 		 494 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2464  nucleotidyl transferase  29.63 
 
 		 504 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0612  nucleotidyl transferase  30.68 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0347  nucleotidyl transferase  30.2 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0798326  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0308  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  30.83 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.684825  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0706  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  30.49 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0349  nucleotidyl transferase  24.58 
 
 		 240 aa  78.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309599  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2751  hypothetical protein  26.92 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2750  hypothetical protein  24.9 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1806  putative nucleotidyltransferase  25.12 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.716393  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1996  hypothetical protein  25.57 
 
 		 548 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0665457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0709  hypothetical protein  21.52 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14021  hypothetical protein  24.71 
 
 		 529 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0305  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  22.33 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.297803  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0615  hypothetical protein  21.25 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2596  dolichyl-phosphate mannose synthase  27.65 
 
 		 231 aa  49.3  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  26.67 
 
 		 330 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0276  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.5 
 
 		 331 aa  45.4  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00854948  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0077  nucleotidyl transferase  27.13 
 
 		 336 aa  43.5  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.760983 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.02 
 
 		 358 aa  43.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.57 
 
 		 354 aa  42.7  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181075 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>