25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3095 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3095  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  221  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.038994 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1295  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  221  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1262  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  221  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1218  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  221  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2830  hypothetical protein  90.99 
 
 
111 aa  184  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.616543  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3009  hypothetical protein  90.99 
 
 
111 aa  184  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2912  hypothetical protein  89.19 
 
 
111 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1176  hypothetical protein  88.29 
 
 
111 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1365  hypothetical protein  87.39 
 
 
111 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1262  hypothetical protein  53.15 
 
 
111 aa  122  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000230441 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2748  hypothetical protein  57.58 
 
 
111 aa  118  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.344464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2914  hypothetical protein  49.04 
 
 
114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1057  hypothetical protein  51.49 
 
 
112 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.455459  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1167  hypothetical protein  53.15 
 
 
111 aa  101  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0897  hypothetical protein  40.78 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.787189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1071  hypothetical protein  52.25 
 
 
111 aa  82  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3239  hypothetical protein  33.04 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2943  hypothetical protein  34.38 
 
 
124 aa  43.9  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3532  membrane protein  31.25 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22213  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3102  transmembrane protein  36 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766019  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3220  putative transmembrane protein  32.29 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2873  hypothetical protein  32.29 
 
 
124 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0329049 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2483  transmembrane protein  25 
 
 
122 aa  41.2  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.226347 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0352  membrane protein  30.53 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0361  membrane protein  30.53 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.485952 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>