19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3771 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0319  Fimbrial assembly family protein  100 
 
 		 179 aa  352  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0816995  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03198  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  352  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0290393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3865  PilN family protein  100 
 
 		 179 aa  352  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0528585  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3771  PilN family protein  100 
 
 		 179 aa  352  2e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03246  predicted fimbrial assembly protein  100 
 
 		 179 aa  352  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0184344  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3589  PilN family protein  98.32 
 
 		 179 aa  345  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00572766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0319  fimbrial assembly family protein  98.32 
 
 		 179 aa  345  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.139922  normal  0.0971984 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4699  PilN family protein  96.65 
 
 		 179 aa  289  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0166356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3671  PilN family protein  95.53 
 
 		 179 aa  281  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000206166  normal  0.11524 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3690  PilN family protein  48.6 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.794853  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3797  PilN family protein  49.16 
 
 		 179 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.416536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3860  PilN family protein  49.16 
 
 		 179 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.793457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3763  PilN family protein  48.6 
 
 		 179 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3688  PilN family protein  48.04 
 
 		 179 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.483537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3807  fimbrial assembly family protein  36.31 
 
 		 172 aa  95.1  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3887  Fimbrial assembly family protein  28.95 
 
 		 189 aa  42.4  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.412256  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0221  fimbrial assembly family protein  27.93 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.632717  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3731  hypothetical protein  27.93 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0670  fimbrial assembly  19.68 
 
 		 193 aa  41.2  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>