11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3946 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3946  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 537 aa  1109    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.488647  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6300  Radical SAM domain protein  73.3 
 
 		 543 aa  825    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0301  Radical SAM domain protein  37.18 
 
 		 537 aa  163  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3150  hypothetical protein  29.19 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0043  radical SAM domain-containing protein  23.79 
 
 		 447 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.970198  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0043  radical SAM domain-containing protein  23.47 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0628937  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1466  Radical SAM domain protein  21.79 
 
 		 467 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1516  Radical SAM domain protein  22.92 
 
 		 469 aa  46.6  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0112694  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1023  Radical SAM domain protein  20.69 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0710  radical SAM domain-containing protein  27.43 
 
 		 516 aa  45.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2939  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 521 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.379543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>