52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2667 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2667  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  158  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149229  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4470  hypothetical protein  71.05 
 
 		 86 aa  89.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1766  hypothetical protein  53.95 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4162  hypothetical protein  52.63 
 
 		 92 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.186646 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1414  hypothetical protein  51.32 
 
 		 88 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0680005  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3873  hypothetical protein  49.35 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0389052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2505  hypothetical protein  46.99 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.460066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3096  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0040  hypothetical protein  61.54 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.479768 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1375  protein of unknown function DUF526  40.96 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308026  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4841  protein of unknown function DUF526  48.68 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0762  hypothetical protein  45 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.468252 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2648  hypothetical protein  47.5 
 
 		 80 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0621  hypothetical protein  45.45 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0261  hypothetical protein  44.44 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.783765 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2263  hypothetical protein  46.05 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1581  hypothetical protein  44.44 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00359975  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0233  hypothetical protein  44.44 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3170  hypothetical protein  47.22 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3332  hypothetical protein  43.59 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296234  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1136  protein of unknown function DUF526  43.9 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059241 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3536  hypothetical protein  41.33 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.764838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2757  protein of unknown function DUF526  45.21 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3020  protein of unknown function DUF526  45.21 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2251  hypothetical protein  45.21 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.801472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0853  hypothetical protein  40.26 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1640  hypothetical protein  42.67 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4948  hypothetical protein  40.26 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.889907  hitchhiker  0.000000138953 
 
 
-
 
NC_004310  BR1526  hypothetical protein  41.89 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1476  hypothetical protein  41.89 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0240368  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4065  protein of unknown function DUF526  36.36 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2214  hypothetical protein  39.53 
 
 		 84 aa  52.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.309689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2149  hypothetical protein  41.1 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3771  hypothetical protein  36.36 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4026  protein of unknown function DUF526  37.66 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.180444  normal  0.460906 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0125  hypothetical protein  47.73 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0675  hypothetical protein  36.36 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0993  hypothetical protein  32.47 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0435364  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0304  hypothetical protein  41.67 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3264  protein of unknown function DUF526  41.82 
 
 		 94 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00236527  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2547  hypothetical protein  44.87 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0524  hypothetical protein  38.03 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.220211  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0060  hypothetical protein  30.56 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2124  hypothetical protein  30.56 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.112916  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1959  hypothetical protein  48.72 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0196  protein of unknown function DUF526  35.37 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.608689 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3220  hypothetical protein  39.29 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000279177  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0215  protein of unknown function DUF526  35.37 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000337039 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0051  hypothetical protein  51.28 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0461056  normal  0.538804 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3600  hypothetical protein  38.98 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3655  hypothetical protein  35.53 
 
 		 79 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3271  hypothetical protein  35.9 
 
 		 85 aa  40  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>