42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0672 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0672  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  200  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4274  hypothetical protein  56.84 
 
 		 94 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2619  hypothetical protein  56.32 
 
 		 100 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.861714  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4404  hypothetical protein  52.75 
 
 		 100 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3948  hypothetical protein  56.84 
 
 		 94 aa  97.1  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2293  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  96.7  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_004310  BR1278  hypothetical protein  55.91 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0196743  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1243  hypothetical protein  55.91 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.061357  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1913  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  93.6  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.602401  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3764  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.211886 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4020  hypothetical protein  50 
 
 		 92 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79512  normal  0.606869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4059  hypothetical protein  48.91 
 
 		 92 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1408  hypothetical protein  44.68 
 
 		 95 aa  87  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.675232  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3650  hypothetical protein  46.46 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0808  hypothetical protein  43.48 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3781  hypothetical protein  45.83 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3671  hypothetical protein  45.83 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3054  hypothetical protein  46.32 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0812076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3473  hypothetical protein  45.83 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.986946  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11010  hypothetical protein  43.62 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4509  cytosolic protein  42.55 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.190159 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3805  hypothetical protein  47.19 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0880  hypothetical protein  42.57 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.353091  normal  0.692775 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4873  hypothetical protein  44.94 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3078  hypothetical protein  46.07 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3110  hypothetical protein  45 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276984  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5303  hypothetical protein  46.39 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0686913  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3088  hypothetical protein  43.01 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11520  hypothetical protein  41.94 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.407986  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1009  hypothetical protein  40.86 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0800  hypothetical protein  35.87 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.662726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1810  hypothetical protein  32.61 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.977987  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0995  hypothetical protein  29.47 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000808008  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3528  hypothetical protein  36.47 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4263  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4084  hypothetical protein  36.84 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000391482 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1687  hypothetical protein  32.22 
 
 		 108 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5850  hypothetical protein  32.11 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.127229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0451  hypothetical protein  48.65 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0104  hypothetical protein  26.04 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.742134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5985  hypothetical protein  35.11 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2008  hypothetical protein  34.41 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>