13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0378 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0378  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4479  hypothetical protein  53.31 
 
 
290 aa  264  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0874335  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4661  hypothetical protein  51.72 
 
 
289 aa  258  8e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.782709  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0274  hypothetical protein  50.19 
 
 
288 aa  244  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8095  hypothetical protein  48.28 
 
 
295 aa  244  8e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4978  hypothetical protein  50.19 
 
 
292 aa  242  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4319  hypothetical protein  50.58 
 
 
294 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4753  hypothetical protein  47.04 
 
 
296 aa  228  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9167  hypothetical protein  48.06 
 
 
296 aa  227  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7036  hypothetical protein  50.26 
 
 
220 aa  191  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2690  hypothetical protein  40.34 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3175  hypothetical protein  25 
 
 
252 aa  57.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4216  hypothetical protein  29.41 
 
 
324 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>