52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4339 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4339  hypothetical protein  100 
 
 		 820 aa  1558    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3948  hypothetical protein  88.29 
 
 		 820 aa  1251    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0508  hypothetical protein  46.5 
 
 		 759 aa  569  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34230  hypothetical protein  41.73 
 
 		 751 aa  458  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.604302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0804  hypothetical protein  43.38 
 
 		 752 aa  449  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.613631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0463  hypothetical protein  42.2 
 
 		 747 aa  419  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0814  hypothetical protein  40.02 
 
 		 790 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8905  hypothetical protein  37.89 
 
 		 789 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4401  hypothetical protein  37.59 
 
 		 837 aa  386  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.433686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3295  hypothetical protein  41.29 
 
 		 857 aa  357  5.999999999999999e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3610  hypothetical protein  37.85 
 
 		 789 aa  350  7e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.746479  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4867  hypothetical protein  37.27 
 
 		 764 aa  349  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0900282 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4571  hypothetical protein  37.27 
 
 		 764 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0747645 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1222  hypothetical protein  36.3 
 
 		 777 aa  347  5e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4484  hypothetical protein  37.35 
 
 		 739 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10879  hypothetical protein  37.36 
 
 		 756 aa  340  5e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.112586 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4772  hypothetical protein  35.42 
 
 		 758 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5054  hypothetical protein  36.58 
 
 		 751 aa  328  3e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0172  hypothetical protein  41.75 
 
 		 876 aa  327  7e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.211375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3945  hypothetical protein  37.95 
 
 		 758 aa  325  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.404517  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8093  hypothetical protein  37.58 
 
 		 761 aa  324  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1699  hypothetical protein  34.97 
 
 		 748 aa  320  6e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.713672 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0788  hypothetical protein  31.89 
 
 		 834 aa  266  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0906  hypothetical protein  31.45 
 
 		 826 aa  263  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.504843 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0815  hypothetical protein  34.07 
 
 		 726 aa  253  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0847  hypothetical protein  35.47 
 
 		 762 aa  239  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435932  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31420  hypothetical protein  38.34 
 
 		 953 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937123  normal  0.115197 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2931  hypothetical protein  43.53 
 
 		 745 aa  205  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21530  hypothetical protein  33.1 
 
 		 779 aa  201  3.9999999999999996e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636597  hitchhiker  0.000150797 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2048  hypothetical protein  28.72 
 
 		 822 aa  196  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2510  hypothetical protein  31.16 
 
 		 798 aa  193  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90638 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3427  hypothetical protein  31.32 
 
 		 840 aa  170  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1999  hypothetical protein  29.6 
 
 		 856 aa  144  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0638496 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07970  hypothetical protein  31.32 
 
 		 719 aa  130  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.281688  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0726  hypothetical protein  45.89 
 
 		 817 aa  119  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0231396  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  32.24 
 
 		 548 aa  58.2  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  32.89 
 
 		 554 aa  56.6  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  33.33 
 
 		 550 aa  55.1  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  31.58 
 
 		 561 aa  50.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 551 aa  49.7  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  33.33 
 
 		 550 aa  49.3  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  32.24 
 
 		 545 aa  48.9  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  28.3 
 
 		 548 aa  46.6  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  31.78 
 
 		 558 aa  46.6  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  29.46 
 
 		 548 aa  46.2  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  31.78 
 
 		 548 aa  46.2  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  30.82 
 
 		 548 aa  46.2  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  30.57 
 
 		 556 aa  46.2  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1917  hypothetical protein  21.26 
 
 		 557 aa  45.8  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00808951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  30.23 
 
 		 548 aa  45.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  33.33 
 
 		 557 aa  45.1  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  31.01 
 
 		 581 aa  44.3  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>