40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0172 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4401  hypothetical protein  66.48 
 
 		 837 aa  1036    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.433686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0172  hypothetical protein  100 
 
 		 876 aa  1666    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.211375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3295  hypothetical protein  40.95 
 
 		 857 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0814  hypothetical protein  41.08 
 
 		 790 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34230  hypothetical protein  38.13 
 
 		 751 aa  433  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.604302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8905  hypothetical protein  38.9 
 
 		 789 aa  432  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8093  hypothetical protein  40.35 
 
 		 761 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3610  hypothetical protein  38.14 
 
 		 789 aa  382  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.746479  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0463  hypothetical protein  41.92 
 
 		 747 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4339  hypothetical protein  40.57 
 
 		 820 aa  336  9e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0804  hypothetical protein  40.06 
 
 		 752 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.613631  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1222  hypothetical protein  38.32 
 
 		 777 aa  326  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4484  hypothetical protein  39.1 
 
 		 739 aa  325  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4867  hypothetical protein  39.1 
 
 		 764 aa  325  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0900282 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4571  hypothetical protein  39.1 
 
 		 764 aa  325  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0747645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5054  hypothetical protein  37.72 
 
 		 751 aa  324  4e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3948  hypothetical protein  40.56 
 
 		 820 aa  310  9e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10879  hypothetical protein  37.79 
 
 		 756 aa  306  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.112586 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1699  hypothetical protein  37.25 
 
 		 748 aa  301  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.713672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4772  hypothetical protein  36.19 
 
 		 758 aa  277  8e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0788  hypothetical protein  32.32 
 
 		 834 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0815  hypothetical protein  39.49 
 
 		 726 aa  273  9e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0508  hypothetical protein  34.87 
 
 		 759 aa  269  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0906  hypothetical protein  31.82 
 
 		 826 aa  254  6e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.504843 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31420  hypothetical protein  37.95 
 
 		 953 aa  233  9e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937123  normal  0.115197 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2931  hypothetical protein  39.87 
 
 		 745 aa  222  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0847  hypothetical protein  33.94 
 
 		 762 aa  221  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435932  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3945  hypothetical protein  44.67 
 
 		 758 aa  209  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.404517  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3427  hypothetical protein  29.36 
 
 		 840 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2510  hypothetical protein  30.1 
 
 		 798 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90638 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21530  hypothetical protein  31.64 
 
 		 779 aa  167  8e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636597  hitchhiker  0.000150797 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2048  hypothetical protein  32.23 
 
 		 822 aa  164  7e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1999  hypothetical protein  31.66 
 
 		 856 aa  160  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0638496 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07970  hypothetical protein  32.02 
 
 		 719 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.281688  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0726  hypothetical protein  42.74 
 
 		 817 aa  115  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0231396  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  31.58 
 
 		 545 aa  51.6  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0970  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.73 
 
 		 230 aa  47.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  29.75 
 
 		 554 aa  46.6  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  29.61 
 
 		 557 aa  46.2  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  32.14 
 
 		 558 aa  44.3  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>