17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2245 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2245  DoxX family protein  100 
 
 
188 aa  366  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0747562  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2102  DoxX family protein  86.7 
 
 
197 aa  315  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0132413  normal  0.296398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6943  DoxX family protein  60.11 
 
 
201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1903  DoxX family protein  57.45 
 
 
184 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.244663  normal  0.193783 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0149  putative integral membrane protein  65.19 
 
 
190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.359577  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0502  hypothetical protein  62.89 
 
 
191 aa  197  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3657  DoxX family protein  53.23 
 
 
184 aa  193  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3436  DoxX family protein  52.43 
 
 
182 aa  191  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3810  DoxX family protein  49.17 
 
 
182 aa  175  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3522  hypothetical protein  61.88 
 
 
182 aa  171  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102706  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2516  DoxX family protein  48.57 
 
 
185 aa  171  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0257788  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0189  DoxX family protein  54.14 
 
 
177 aa  169  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.284056  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10640  DoxX protein  55.9 
 
 
186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0732523 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4739  DoxX family protein  55.28 
 
 
191 aa  158  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3582  DoxX family protein  43.88 
 
 
205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8099  putative integral membrane protein  34.41 
 
 
119 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1241  DoxX family protein  28.41 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>