42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1982 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1982    100 
 
 
261 bp  517  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268441  normal  0.248376 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0298    85.37 
 
 
186 bp  101  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0391304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1285    89.02 
 
 
192 bp  91.7  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122916  hitchhiker  0.00261898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4694  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  86.67 
 
 
1212 bp  69.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3140    86.67 
 
 
1740 bp  69.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2014    82.09 
 
 
317 bp  61.9  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.951363  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6332    90 
 
 
447 bp  60  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4714  transposase IS116/IS110/IS902  96.97 
 
 
1263 bp  58  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.97 
 
 
1263 bp  58  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1867  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  96.97 
 
 
1263 bp  58  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6212  transposase IS116/IS110/IS902  96.97 
 
 
1263 bp  58  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4744  transposase IS116/IS110/IS902  96.97 
 
 
1263 bp  58  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3689  transposase IS116/IS110/IS902  96.97 
 
 
1263 bp  58  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.767433  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2654  transposase IS116/IS110/IS902  96.97 
 
 
1263 bp  58  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2516  transposase IS116/IS110/IS902  96.97 
 
 
1263 bp  58  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0354  transposase IS116/IS110/IS902  96.97 
 
 
1263 bp  58  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5636  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
1206 bp  52  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3194  ISBma3, transposase  100 
 
 
1263 bp  52  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2836  ISBma3, transposase  100 
 
 
1263 bp  52  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1190  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
1206 bp  52  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140816  normal  0.0159286 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1755  ISBma3, transposase  100 
 
 
1263 bp  52  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00342149  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1754  ISBma3, transposase  100 
 
 
1263 bp  52  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534372  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1545  ISBma3, transposase  100 
 
 
1263 bp  52  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1387  transposase  93.94 
 
 
1263 bp  50.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1289  transposase  93.94 
 
 
1263 bp  50.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
1200 bp  50.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  0.201189 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21750  transposase  96.55 
 
 
1227 bp  50.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.747437  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12160  transposase  96.55 
 
 
1227 bp  50.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145073  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1964  transposase  93.94 
 
 
1263 bp  50.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0642  transposase  93.94 
 
 
1263 bp  50.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0735  transposase  93.94 
 
 
1263 bp  50.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1893  transposase  93.94 
 
 
1281 bp  50.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2615  transposase  93.94 
 
 
1263 bp  50.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0243344  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2763  putative transposase IS110  93.94 
 
 
1263 bp  50.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0480    93.94 
 
 
1224 bp  50.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1195  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  93.94 
 
 
1263 bp  50.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1413    93.94 
 
 
467 bp  50.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2708    93.94 
 
 
579 bp  50.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3480  putative transposase  93.94 
 
 
1263 bp  50.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0156  putative transposase  93.94 
 
 
1263 bp  50.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0716  transposase IS116/IS110/IS902  93.94 
 
 
1263 bp  50.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31796  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4393  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  89.74 
 
 
1266 bp  46.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>