22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1937 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1937  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  462  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2526  hypothetical protein  55.9 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.755196  normal  0.82322 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2451  hypothetical protein  57.47 
 
 		 237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2431  hypothetical protein  55.61 
 
 		 242 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.344644  normal  0.298555 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1895  hypothetical protein  55.61 
 
 		 242 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.731685  normal  0.571697 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2107  hypothetical protein  55 
 
 		 234 aa  245  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.717396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1861  hypothetical protein  55.61 
 
 		 242 aa  245  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.929031  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1888  hypothetical protein  55.61 
 
 		 242 aa  245  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.169279  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1758  hypothetical protein  54.71 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.162023  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2389  hypothetical protein  51.9 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942806 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2257  hypothetical protein  52.14 
 
 		 235 aa  239  4e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2584  hypothetical protein  52.56 
 
 		 237 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2180  hypothetical protein  52.56 
 
 		 235 aa  230  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.842277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1730  hypothetical protein  52.27 
 
 		 225 aa  229  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.716461  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2191  hypothetical protein  53.12 
 
 		 233 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604647  hitchhiker  0.000928347 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1622  hypothetical protein  51.2 
 
 		 227 aa  198  6e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1186  hypothetical protein  40.53 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3749  hypothetical protein  28.12 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04854  conserved hypothetical protein  32.26 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16922  predicted protein  35.44 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4217  hypothetical protein  24.02 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000127918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1655  hypothetical protein  45.65 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0155493  normal  0.785043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>