27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1915 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1915  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  257  4e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.130481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2497  hypothetical protein  60.32 
 
 		 124 aa  150  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.404496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1825  hypothetical protein  60.32 
 
 		 124 aa  150  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0194222  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1788  hypothetical protein  60.32 
 
 		 124 aa  150  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1781  hypothetical protein  59.52 
 
 		 124 aa  146  8e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0111743  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1753  hypothetical protein  58.27 
 
 		 125 aa  140  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.819388  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2872  hypothetical protein  62.2 
 
 		 124 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1839  hypothetical protein  55.74 
 
 		 123 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  0.17507 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1645  hypothetical protein  55.56 
 
 		 142 aa  134  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2167  hypothetical protein  54.1 
 
 		 123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1693  hypothetical protein  61.29 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337002  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1647  hypothetical protein  62.7 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2421  hypothetical protein  63.49 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0112375  hitchhiker  0.000913176 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2349  hypothetical protein  62.7 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0136957  decreased coverage  0.000000000361738 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1969  hypothetical protein  57.85 
 
 		 123 aa  117  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00366875  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2439  hypothetical protein  55.2 
 
 		 123 aa  117  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685345 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1747  hypothetical protein  48.54 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03196  hypothetical protein  50.43 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002785  hypothetical protein  48.72 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3192  hypothetical protein  38.66 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0660225  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02145  hypothetical protein  38.33 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123559  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1072  hypothetical protein  36.21 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2386  hypothetical protein  39.36 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2486  hypothetical protein  42.99 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0981  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0866  membrane protein-like protein  44.9 
 
 		 127 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.060146  normal  0.425014 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0898  translation elongation factor Tu  30.43 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000668063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>