22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1720 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1720  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  216  7e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0324758  normal  0.0484003 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1906  hypothetical protein  61.9 
 
 		 105 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00307776  hitchhiker  0.00000810747 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2072  hypothetical protein  61.9 
 
 		 105 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00802989  hitchhiker  0.0013578 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1961  hypothetical protein  61.9 
 
 		 105 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.107623  normal  0.0653697 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2052  hypothetical protein  62.86 
 
 		 105 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2048  hypothetical protein  62.86 
 
 		 105 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0280771  hitchhiker  0.0000000000443761 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2299  hypothetical protein  62.86 
 
 		 105 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000877554  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2423  hypothetical protein  61.9 
 
 		 105 aa  148  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2414  hypothetical protein  61.9 
 
 		 105 aa  147  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0386713  hitchhiker  0.000131531 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1943  hypothetical protein  61.9 
 
 		 105 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1938  hypothetical protein  59.05 
 
 		 105 aa  140  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.352861  normal  0.0103155 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2256  hypothetical protein  60 
 
 		 105 aa  137  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000838797  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2296  hypothetical protein  56.19 
 
 		 105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000823465  normal  0.375407 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2148  hypothetical protein  57.14 
 
 		 105 aa  124  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.148893  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2314  hypothetical protein  55.24 
 
 		 105 aa  123  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000296556  hitchhiker  0.000816285 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1904  hypothetical protein  53.33 
 
 		 105 aa  123  9e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.146176  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2564  hypothetical protein  40.74 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0644759  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1643  hypothetical protein  36.11 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.947428  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1620  hypothetical protein  30.61 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2506  hypothetical protein  65.22 
 
 		 249 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3178  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0699  hypothetical protein  59.26 
 
 		 171 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.385809  hitchhiker  0.00025421 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>