20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2564 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2564  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  227  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0644759  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1643  hypothetical protein  46.23 
 
 
108 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.947428  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1720  hypothetical protein  40.74 
 
 
105 aa  92  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0324758  normal  0.0484003 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1938  hypothetical protein  42.59 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.352861  normal  0.0103155 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1904  hypothetical protein  37.04 
 
 
105 aa  85.9  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.146176  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2048  hypothetical protein  39.81 
 
 
105 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0280771  hitchhiker  0.0000000000443761 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2299  hypothetical protein  39.81 
 
 
105 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000877554  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2052  hypothetical protein  39.81 
 
 
105 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2072  hypothetical protein  38.89 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00802989  hitchhiker  0.0013578 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1906  hypothetical protein  38.89 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00307776  hitchhiker  0.00000810747 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1961  hypothetical protein  37.96 
 
 
105 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.107623  normal  0.0653697 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2414  hypothetical protein  38.89 
 
 
105 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0386713  hitchhiker  0.000131531 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1943  hypothetical protein  37.96 
 
 
105 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2256  hypothetical protein  38.89 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000838797  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2423  hypothetical protein  37.04 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2148  hypothetical protein  37.04 
 
 
105 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.148893  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2314  hypothetical protein  38.32 
 
 
105 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000296556  hitchhiker  0.000816285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2296  hypothetical protein  31.78 
 
 
105 aa  70.1  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000823465  normal  0.375407 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01262  hypothetical protein  48.72 
 
 
41 aa  50.4  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2506  hypothetical protein  38.98 
 
 
249 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>