21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1643 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1643  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  227  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.947428  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2564  hypothetical protein  46.23 
 
 		 109 aa  106  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0644759  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2314  hypothetical protein  38.68 
 
 		 105 aa  83.6  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000296556  hitchhiker  0.000816285 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1720  hypothetical protein  36.11 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0324758  normal  0.0484003 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2256  hypothetical protein  35.85 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000838797  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2052  hypothetical protein  37.96 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2048  hypothetical protein  37.96 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0280771  hitchhiker  0.0000000000443761 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2299  hypothetical protein  37.96 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000877554  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1943  hypothetical protein  36.11 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1961  hypothetical protein  37.04 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.107623  normal  0.0653697 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2414  hypothetical protein  37.96 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0386713  hitchhiker  0.000131531 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1938  hypothetical protein  34.26 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.352861  normal  0.0103155 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2072  hypothetical protein  35.19 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00802989  hitchhiker  0.0013578 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1906  hypothetical protein  35.19 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00307776  hitchhiker  0.00000810747 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2296  hypothetical protein  33.02 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000823465  normal  0.375407 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1904  hypothetical protein  30.56 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.146176  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2423  hypothetical protein  36.11 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2148  hypothetical protein  30.56 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.148893  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01262  hypothetical protein  53.85 
 
 		 41 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2506  hypothetical protein  63.33 
 
 		 249 aa  50.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1961  hypothetical protein  60 
 
 		 338 aa  40.8  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.865494  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>