51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2967 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2967  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  684    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal  0.0170262 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0462  hypothetical protein  48.77 
 
 		 356 aa  249  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.723266  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3128  protein of unknown function DUF95 transmembrane  42.64 
 
 		 342 aa  238  8e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2676  hypothetical protein  43.08 
 
 		 333 aa  229  6e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5852  hypothetical protein  31.35 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3801  hypothetical protein  31.27 
 
 		 322 aa  122  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4811  hypothetical protein  29.63 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00997057  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2278  protein of unknown function DUF95 transmembrane  31.06 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0756  hypothetical protein  30.7 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3743  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.23 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4440  integral membrane protein  29.67 
 
 		 325 aa  109  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.627062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3317  hypothetical protein  29.46 
 
 		 328 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945777 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1082  hypothetical protein  30.47 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1334  hypothetical protein  28.8 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1272  protein of unknown function DUF95 transmembrane  30.63 
 
 		 328 aa  100  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000243278 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2502  putative integral membrane protein  28.04 
 
 		 331 aa  99.4  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0410  hypothetical protein  29.55 
 
 		 342 aa  97.4  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5458  hypothetical protein  27.96 
 
 		 330 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3215  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.31 
 
 		 331 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0604768  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3912  integral membrane protein  30.16 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00542014  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3575  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.1 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4022  integral membrane protein  30.37 
 
 		 326 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.96338  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56110  hypothetical protein  27.49 
 
 		 326 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4888  hypothetical protein  27.79 
 
 		 326 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.32174  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2133  hypothetical protein  24.85 
 
 		 603 aa  94  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38340  hypothetical protein  29 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.5603  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4050  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.39 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3829  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.23 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157843  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3844  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.4 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4823  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.46 
 
 		 331 aa  89.4  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20720  uncharacterized membrane protein  30.27 
 
 		 331 aa  88.6  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04898  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1202  integral membrane protein  30.99 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.525523  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4318  integral membrane protein  30.84 
 
 		 326 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1613  hypothetical protein  27.79 
 
 		 337 aa  86.3  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0233991 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09270  uncharacterized membrane protein  29.3 
 
 		 329 aa  85.9  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.130747 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09283  hypothetical protein  25.3 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1404  membrane protein-like protein  27.44 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3752  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.44 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2521  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.83 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.626612  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1835  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.06 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.920974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4959  protein of unknown function DUF95 transmembrane  35.29 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000637265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7600  protein of unknown function DUF95 transmembrane  25.61 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0773481  normal  0.0891448 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1683  protein of unknown function DUF95 transmembrane  25.45 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4862  hypothetical protein  27.27 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4951  hypothetical protein  27.27 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4267  hypothetical protein  27.81 
 
 		 335 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000574123  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5230  hypothetical protein  27.27 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.230023  normal  0.753806 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0233  protein of unknown function DUF95 transmembrane  31.03 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13725  transmembrane protein  24.62 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258744  normal  0.61477 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2338  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.87 
 
 		 329 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00579329  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2232  hypothetical protein  21.58 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0377235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>