18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1133 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1133  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  169  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.433125  normal  0.699348 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1084  hypothetical protein  78.95 
 
 		 60 aa  96.7  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4321  hypothetical protein  78.57 
 
 		 59 aa  91.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2679  hypothetical protein  77.78 
 
 		 58 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3251  protein of unknown function DUF1508  58.82 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.85625  normal  0.147976 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3548  protein of unknown function DUF1508  56.86 
 
 		 62 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0113  hypothetical protein  52.83 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2168  hypothetical protein  47.06 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276428  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2613  hypothetical protein  48.98 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40017  normal  0.147293 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2018  protein of unknown function DUF1508  44.9 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1784  hypothetical protein  47.17 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0566644  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4181  hypothetical protein  42.59 
 
 		 110 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1529  hypothetical protein  45.28 
 
 		 111 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3097  hypothetical protein  49.02 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00116943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1326  hypothetical protein  49.02 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1209  hypothetical protein  49.02 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000359966  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3560  hypothetical protein  45.83 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1307  hypothetical protein  42.86 
 
 		 62 aa  40  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.280375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>